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本室目前正以活体为对象，发展在线、原位或在体的分析方法，以其最终能直接探讨生命活体中，各种生物分子是如何利用化学原理，进行复杂的时空运动，来实现生命功能的。研究分四个相互关联层面，首先是发展针对活体动物的微扰、微损乃至无损的取样方法，包括构建适合于分析方法研究的动物模型；其次是发展针对复杂生物样品的高选择性分析方法，目前研究包括研究和开发各种化学与生物识别技术，构建光、电、生物传感与探测新方法等；第三是发展多组分、多参数、高通量的分析与鉴定方法，目前研究包括毛细管电泳、微流控技术、生物色谱、生物质谱、表面等离子体共振成像（SPRi）、联用技术等；最后是将所发展的方法用于活体生物中的一些基础化学问题研究，包括活性分子的时－空关系及其对应生物功能探讨，活性生物大分子局域结构探测等。
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